中药薏苡仁性味甘、淡，微寒，归肺、脾、胃经。功效主要为利水渗湿，健脾除痹，清热排脓。它的主要作用为用于小便不利，水肿，脚气及脾虚泄泻等。本品甘补淡渗，功效类似于茯苓，对于脾虚湿滞者尤为适用。若脾虚湿盛之水肿，腹胀，食少泄泻，脚气，浮肿等，可以考虑茯苓、白术、黄芪等药物相须为用。又因其性偏凉，能清利湿热，也可用于湿热淋证。
其次用于湿痹拘挛。本品能渗湿又能舒筋脉，缓和挛急。若风湿身痛发热者，可以与麻黄、杏仁、甘草等同用。如果风湿久痹，筋脉挛急，水肿，用薏苡仁煮粥可以起到很好的效果。如果湿郁热蒸，蕴于经络，可与滑石、连翘等同用，最后可以用于肺痈、肠痈。本品清肺肠之热，排脓消痈。若肺痈胸痛，咳吐脓痰，可以与苇茎、冬瓜仁、桃仁等同用，如《千金方》中的苇茎汤。治疗肠痈可与附子、败酱草、丹皮等配伍，如附子薏苡仁败酱散。