治疗葡萄球菌的方法有两部分，第一是对药物敏感的葡萄球菌的治疗，主要选择青霉素类和头孢菌素类药物。还有一部分临床耐药，尤其是在医院感染的葡萄球菌，它需要使用一种能够抵抗耐药细菌的药物，如万古霉素、糖肽。此外，营养的支持、心肺功能维持等也很重要。