目前临床上认为卵巢囊肿对于女性的月经周期会有一定的影响，因为卵巢囊肿本身是由于妇科内分泌失调所引起的，导致的卵巢功能异常从而导致性激素分泌异常。一般小于五厘米的囊肿也称之为黄体囊肿，随着月经周期会恢复正常会自动的消失。如果卵巢囊肿大于五厘米，首先要排除恶性肿瘤的可能性，如果不存在恶变的话，应该尽早的采取药物治疗或者是手术治疗。在临床上可以在医生的指导下选取一些药物来进行治疗，但是如果是卵巢巧克力囊肿则可以考虑手数切除，因为巧克力囊肿会引起进行性痛经，甚至会影响卵巢功能导致不孕症的发生。

卵巢囊肿是女性的常见疾病，一般分为肿瘤性和非肿瘤性。肿瘤性卵巢囊肿直径在五、六公分以上，不随月经发生变化；医生建议尽早手术，不建议长期随诊观察，因为肿瘤性囊肿存在恶变的潜在风险。非肿瘤性囊肿，如卵泡囊肿、黄体囊肿，直径一般两、三公分大小，常在几次月经后会吸收消退，通常不需要进一步处理。非肿瘤性囊肿也是慢性附件炎、输卵管积水的表现，输卵管积水也表现为附件区的囊肿，与卵巢囊肿很难区别。B超可见囊壁较薄，呈腊肠样的囊肿，患者多有慢性盆腔炎的病史，此类囊肿，如症状明显，可手术治疗；大部分症状不明显，不需要手术治疗，长期随诊观察便可。

绝经后有一部分卵巢囊肿会消失，尤其是卵巢的生理性囊肿，是由卵巢分泌的雌孕激素的作用所导致。当绝经后，分泌的雌孕激素水平下降，生理性囊肿一般不会出现。子宫内膜异位症囊肿也有可能随着卵巢功能的衰退，在绝经后缩小甚至消失。因此子宫内膜异位症囊肿绝经期前比较小暂时不用手术治疗，在但在绝经后有一部分的囊肿是不会消失，比如像浆液性囊腺瘤、粘液性囊腺瘤等等，甚至会有新出现的卵巢囊肿。这种情况要引起重视，卵巢功能衰退，新出现的卵巢囊肿往往是病理性的囊肿，要进行密切的观察和随访，如果仍持续存在或增长，则需手术治疗。

卵巢囊肿如果是生理性的囊肿，不需要治疗，它自己会吸收会消失。病理性的囊肿应该进行手术干预，手术干预的目的，第一是为了要明确诊断，取到卵巢的囊肿壁进行病理检查，确定到底是什么样的囊肿。比如说是上皮性的肿瘤，还是生殖细胞肿瘤，还是一个性索间质肿瘤等等，是良性的还是交界性的，还是恶性的呢？我们必须要通过取到囊肿壁才能拿到最确切的病理诊断。如果这个囊肿它是一个复发率很高的囊肿，比如说卵巢的子宫内膜异位样囊肿，或者是卵巢的浆液性囊性瘤、粘液性囊性瘤等等。在初次手术已经明确诊断的情况下，又复发了。这个时候可以考虑在超声引导下穿刺抽液进行治疗，抽液以后在囊肿壁内注入一些无水酒精破坏囊肿内壁的上皮，然后达到一个治疗的效果。但总的来讲，卵巢囊肿第一选择就是手术。是开腹做，是腹腔镜做还是经阴道做，要取决于术者他的习惯和经验。目前来讲，卵巢的良性的囊肿，最好的选择方法是腹腔镜。因为腹腔镜治疗卵巢囊肿手术，是一个最佳的微创选择。当然如果这囊肿很大，怀疑它有恶性的，可能最好还是开腹手术。但不管怎么说，卵巢囊肿最好的治疗方法是手术剥除，或者是手术切除。

小的卵巢囊肿要看生长速度，还有就是提示卵巢囊肿性质的倾向性指标，比如肿瘤标记物是否升高，超声影像学提示有恶性的可能，这时候不论大小都需要积极治疗。卵巢囊肿看大小是一方面，根据大小来判断需不需要去治疗，小的囊肿且确定是良性或者是短期内有随访的条件，并不一定需要很积极治疗，要担心的是通过影像学这种无创的检查没有办法鉴定出性质的卵巢囊肿，需要早一点干预性治疗，要取病理来判定性质，所以卵巢囊肿的大小是决定是否需要治疗一个参考指标。