慢性萎缩性胃炎，作为一种癌前疾病，预后是不同的病人有不同的的预后的结果，每年据统计，大约有百分之0.5到百分之1的病人可能会转变成胃癌，但是也是多重因素作用的结果，包括幽门螺旋杆菌的感染，以及有一定的遗传倾向，还有长期饮食的不规律，都是造成萎缩性胃炎癌变的一些风险。
对于慢性萎缩性胃炎，考虑和幽门螺旋杆菌的感染是有很大的相关性，当在胃镜下发现了这种萎缩的存在，需要进一步的去检测幽门螺旋杆菌，如果有这种细菌的感染，进行一个积极的根除治疗之后，轻度的萎缩是有一定的逆转的可能性的，但是通常慢性萎缩性胃炎会伴有肠上皮化生，对于出现这种肠上皮化生之后，逆转的可能性是会有下降的，当出现了重度的慢性萎缩性胃炎，同时伴有重度的肠上皮化生，一定要警惕，因为发生胃癌的风险会升高。
所以如果有慢性萎缩性胃炎的存在的时候，要定期监测胃镜，关注胃粘膜的细胞的改变，有没有出现异性增生或者是早期癌变的发生。