肛瘘手术2周以后，基本上就可以看到新鲜的肉芽生长，肛瘘手术后肛门部位处于污染创面，污染创面在伤口急性炎症期，会持续时间比较长，而急性炎症期，一般在肛门部位是1-2周，由于肛门的新鲜创面，而且很多时候创面是在开放状态，由于粪水的污染、排便的影响、炎症刺激，这种新鲜创面表面会先经过去腐生肌的过程，也就是临床上会看到早期肛门会有很多渗出物，会有坏死的组织，甚至会有黏液样、脓苔样的组织，这都是由于表面被粪水污染以后的现象，随着急性炎症期度过，2周以后肛门伤口渗出渗液，这种脓性分泌物就会大大的减少，然后可以看到肛瘘的创面，会出现比较新鲜的、鲜红的肉芽，这个时候就是肉眼可以见到的所谓的长伤口或者长肉，这个时候创面疼痛，分泌物的渗液量都会大大的减少，疼痛也减轻，而有的甚至会开始出现伤口长肉芽的轻微瘙痒症状，这都代表新鲜肉芽在生长，通常过了2周以后，这样创面就可能会出现长肉的现象。但如果肛瘘是在伴随脓肿的状态下完成的手术，这个过程可能就会延后，因为脓肿、坏死组织引流以及去腐生肌的过程，会变得延长，而且有些肛瘘手术需要做挂线，在肌肉深处的组织，坏死组织引流，时间可能会变得更长，但绝大多数肛瘘手术创面2周以后，会开始出现新的肉芽生长。

确诊肛瘘最常做的检查是肛门直肠检查，同时结合索罗门定律，即可作出诊断。对于肛瘘比较严重的患者在这些检查的基础上，可以通过腔内超声、窦道造影、磁共振、三维重建、螺旋CT等来确定诊断。主要还是要看内口、外口和瘘管道的情况，最重要是弄清瘘管与肛门括约肌的关系，因为内口和瘘管是最重要的，而在他们三者的形成和肛门括约肌的关系，从临床上就可以直接决定肛瘘的具体分型和治疗难度以及治疗后的效果。同时可以做肛镜，检查找出可疑的肛隐窝，以便医生确定及早进行手术。

肛瘘和肛周脓肿其实是同一种疾病的不同分期。换句话说，肛瘘和肛周脓肿都是因为坐骨直肠周围间隙感染所引起的临床疾病。肛瘘的发病原因，也就是坐骨直肠周围间隙感染。在感染急性期脓肿形成，肛周脓肿表现为局部的红肿热痛，波动感阳性。此时通常需要及时的行脓肿切开引流，如果脓肿位置比较深在。通常在临床上还需要置管引流，并持续负压冲洗，冲洗液中可以加入甲硝唑等抗生素药物，同时予以静脉注射抗生素控制。控制感染。而慢性期，通常是因为，急性期行脓肿切排以后，瘘管迁延不愈，所形成的肛瘘。肛瘘在解剖学上包括内口，外口与窦道，一旦形成肛瘘，在临床上避免一次手术损伤的肛管直肠环，绝大多数采用挂线治疗可以达到治愈的效果。

肛瘘在中医上又称为穿肠瘘，指的是肛门上部的直肠和肛门旁边的皮肤之间形成的异常管道，称之为肛瘘。管道是从肛门外面通到肠腔里边的，通常肛瘘有一条管道，称之为单纯性肛瘘。如果是超过1个以上，称为复杂性肛瘘。所以对复杂性肛瘘的定义是有2个或2个以上的内口或者外口，有2条以上的瘘管或枝管、盲管的肛瘘，复杂性肛瘘一般最常见的，在临床上有2个以上的外口，有多个枝管。所以在治疗过程当中比较复杂，在治疗上比较棘手。针对复杂性肛瘘的治疗采取手术时，要注意完全的找到所有的管道进行切除。

通常如果确诊肛瘘以后，还是建议患者及早进行手术的治疗，这是为什么呢？因为肛瘘的感染是由于肛门内的肛线感染向外蔓延引起的，肛瘘的内口实际上是在肠腔内的，它是长期接触粪便、细菌，反复的去污染它的，如果肛瘘的内口不能完全愈合的话。通过常用的抗感染的治疗是不能完全治愈的，这就好比一个污水池，它的进水口一直开着，即使把外面的污水排净，但是内口一直在开放，脏的东西一直在进来，肯定是要反复发作，这种情况下，就只能通过手术的治疗清除肛瘘的瘘道以及内口、外口这些组织，让它彻底的愈合以后才不会反复的发作，肛瘘要尽早治疗，而且手术治疗是唯一治愈的手段。