过敏性结膜炎可以找到过敏原，通过过敏原实验知道对哪种药物过敏，然后进行脱敏治疗，还有物理疗法。用抗过敏的药，有肥大细胞稳定剂、抗组胺药物、抗炎药物等，还有双效作用，既抗组胺又稳定肥大细胞的，都能在短期内能够缓解症状。但是一旦停止用药，再接触过敏原还是会复发的。首先过敏性结膜炎治疗最重要、最直接治疗方案就是脱离过敏原，但是脱离过敏原很难做到，因为很多时候过敏是花粉、尘土或者是螨虫，这种空气中到处都在，除非进入一个真空的环境中。
物理疗法，比如在过敏季节，出门的时候带防风镜，不让过敏原接触眼睛，就会减少过敏的发生。另外过敏的时候不要揉眼睛，揉眼睛会越揉越痒，如果皮肤上被蚊子咬个包之后会特别痒，要去挠，挠的情况下会把挠破，才觉的皮肤不痒了，眼睛也一样，会挠到眼睛痛了才会停下来，这时候可能会对眼睛造成一定的损伤，所以最好不要去揉也不要挠，可以用冰敷一下可以缓解一下眼痒的症状。然后可以全身用抗过敏的药，比如说吃抗过敏的药，西斯米或者是开瑞坦之类的药，都能够缓解眼部的症状。另外如果有过敏性鼻炎，过敏性哮喘也一定一并治疗，对于比较严重的症状，还需要全身口服激素，才能够使过敏结膜炎得到稳定。所以要根据不同症状、不同体征和不同类型，选择不同药物进行治疗。