补充碘剂是预防和治疗甲状腺肿的最主要措施，食用碘盐是有效且相对安全的方法。其治疗方法还包括内科治疗、手术治疗、碘131治疗等。
对于碘缺乏引起地方性甲状腺肿，补充碘剂是预防和治疗本病的最主要措施。根据国际防治碘缺乏病权威组织的建议，食用碘盐是有效且相对安全的方法，理想的成人碘摄入量是每人每天150微克，一般来说，弥漫性甲状腺肿经持续性补碘的6到12个月，甲状腺肿可回缩至正常，少数需数年时间。妊娠期的碘摄入量务必保证在250微克每天。青春期甲状腺肿大可多自行消退，轻度的无症状的甲状腺肿可以暂时不予处理，密切观察临床症状和定期随访评估病情即可。
同位素治疗对于部分腺体过大，内科治疗无效且不能耐受手术的病人，以及术后复发的病人，是可以考虑用碘131来治疗。碘131治疗在缩小甲状腺体积方面的疗效是可靠的，治疗后甲状腺的体积逐渐缩小，绝大多数患者在6到12个月后，可缩小至50%左右。碘131治疗后可能出现甲减、一过性的甲状腺毒症等，故需要密切随访甲状腺功能。手术治疗指征是指腺体过大，妨碍了工作和生活，引起压迫症状，且内科治疗无效的，腺体内有结节，可疑有发展为癌肿或者是甲状腺功能亢进者，是可以考虑手术治疗。