肉芽肿性甲状腺是否是恶性要根据具体的情况来判断。患者出现明显的症状时，很有可能是恶性的，这种情况下要尽早去医院检查，明确具体的病情后选择手术方法进行治疗，能够减少对身体的影响。当患者症状比较轻微时，一般是良性的。这时患者要定期去医院检查，在医生的指导下选择合适的药物进行控制，也能够起到比较好的治疗效果。