小儿分泌性中耳炎的病因多种多样，主要是上呼吸道感染，鼻腔黏膜充血水肿，导致咽鼓管阻塞，影响中耳内液体的循环流动，其它常见的原因包括：腺样体肥大，扁桃体肥大，均可阻塞咽鼓管，使分泌物淤积。咽鼓管本身的功能障碍也会引起分泌性中耳炎，当发生过敏性鼻炎时，鼻腔黏膜充血，也会导致咽鼓管阻塞，中耳腔内负压，引起分泌性积聚。