生殖器疱疹主要通过性接触传播，本病的传染性极强，凡与患有阴茎疱疹的男性发生一次性接触的女性，约有80％可受感染。此外，接触生殖器疱疹患者使用过的衣服、被褥、马桶和浴巾等均可能被患者的分泌物污染而带上生殖器疱疹病毒。生殖器疱疹通过性生活传染，便可以长期潜居在人体生殖器皮肤和黏膜细胞内，不离开人体，可以暂时不发病。但是，当人体抵抗力降低时，例如感冒、发热、病灶感染、月经失调、胃肠功能紊乱、过敏反应，以及饮酒、过度劳累，甚至人体的情绪变化，都能使人体抵抗力降低，都可以使潜伏的疱疹病毒重新活动起来，引起一次发作。