其病因主要是免疫紊乱产生了自身抗体，使神经肌肉接头处乙酰胆碱不能和受体（Ach-R）结合而发生正常的肌肉收缩功能。而产生抗体的根源就在胸腺及其周围脂肪组织。相关研究证明：胸腺是产生致病抗体——乙酰胆碱受体抗体的主要场所，本病的发生与胸腺有密切的关系，胸腺中的T细胞、B细胞、肌样细胞对重症肌无力的发生起着重要作用。